El ARN no codificante largo circulante GAS5 se sobreexpresa en el suero de pacientes osteoporóticos y se relaciona con un elevado riesgo de fragilidad ósea
La osteoporosis (OP) es una disfunción multifactorial por la que se han implicado partes ambientales junto con variantes genéticas y mecanismos epigenéticos. Largo no codificantes ARNs (lncRNAs) simplemente han surgido actualmente como importantes reguladores del metabolismo óseo y OP etiología.
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En este análisis, se analizó el diploma de expresión y la afiliación genética de lncRNA GAS5 en las víctimas OP en comparabilidad con los controles. El análisis cuantitativo RT-PCR de GAS5 se llevó a cabo en el suero de 56 víctimas de OP y 28 personas sanas. Los sujetos con OP se dividieron en tres grupos de análisis: 29 con fracturas por fragilidad de la columna lumbar (OP_VF), 14 con fracturas por fragilidad del cuello femoral (OP_FF) y 13 sin fracturas (OP_WF). La genotipificación del polimorfismo de inserción/deleción rs145204276 se ha llevado a cabo además mediante análisis de polimorfismo de medición de fragmentos de restricción (RFLP) y secuenciación directa.
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La expresión de GAS5 circulante es significativamente elevada en las víctimas de OP en comparación con los controles (p <0,01), con una significación estadísticamente mayor en las personas con OP fracturada frente a los sujetos sanos (p <0,001). No se observaron cambios estadísticamente significativos en las mujeres víctimas de OP; por el contrario, el GAS5 está regulado al alza en el suero de las niñas con OP fracturada (p < 0,01) y en todos los varones con OP (p < 0,05). Por otra parte, una correlación directa entre GAS5 diploma de expresión y la hormona paratiroidea (PTH) foco fue actual en las víctimas OP (r = 0,2930; p = 0,0389).
El análisis genético de rs145204276 reveló que el alelo de deleción se correlacionó con la posterior expresión de GAS5 en las víctimas de OP (0,22 ± 0,02 frente a 0,15 ± 0,01, ** p < 0,01). Nuestros resultados abogan por GAS5 circulante como un biomarcador putativo para el pronóstico y el pronóstico de OP y fracturas relacionadas con OP.
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| 310-005 | GeneOn |
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La interacción entre los ARN no codificantes prolongados y las proteínas del equipo epigenético en la mayoría de los cánceres de ovario
La secuenciación completa a gran escala y los análisis bioinformáticos han descubierto una miríada de ARN no codificantes prolongados (lncRNAs) asociados al cáncer. La expresión aberrante de lncRNAs se dice que la reprogramación epigenética durante todo el desarrollo tumoral y la mejora, principalmente atribuible a su potencial para trabajar junto con el ADN, ARN, o proteínas para manejar la expresión génica. LncRNAs participar en toda la administración de los patrones de expresión génica en todo el desarrollo y la diferenciación celular y puede muy bien ser la célula y la mayoría de los cánceres de tipo explícito.
En este resumen, se describe el potencial de lncRNAs para funciones científicas en la mayoría de los cánceres de ovario (OC). El CO es una enfermedad florida y heterogénea caracterizada por recaídas, quimioresistencia y tasas de mortalidad extremas. A pesar de los avances en el pronóstico y el tratamiento, no se han observado mejoras significativas en la supervivencia a largo plazo de las víctimas de cáncer de ovario. Un conjunto de lncRNAs se asoció a la supervivencia y la respuesta al tratamiento en este tumor maligno.
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Hemos curado manualmente bases de datos y utilizado dispositivos bioinformáticos para descubrir lncRNAs implicados a lo largo de la regulación epigenética, junto con ejemplos de interacciones directas entre los lncRNAs y proteínas del engranaje epigenético en OC.
Las fuentes y mecanismos aquí aportados pueden mejorar la comprensión de la biología de la OC y proporcionar el concepto para investigaciones adicionales en relación con la variedad de nuevos biomarcadores y dianas terapéuticas.
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La terminación temprana del transcrito de la toxina Shiga genera un ARN pequeño regulador
La Escherichia coli enterohemorrágica es un patógeno humano vital que causa enfermedades que van desde la colitis hemorrágica hasta el síndrome urémico hemolítico. Este último puede acabar en una insuficiencia renal sin duda letal y se produce por la descarga de toxinas Shiga codificadas en bacteriófagos lambdoides.
Las toxinas están codificadas a través del transcrito tardío del fago y están reguladas por la antiterminación del promotor tardío PR’ durante la inducción lítica del fago. A lo largo de la lisogenia, el transcrito tardío se termina prematuramente en tR’ inmediatamente aguas abajo de PR’, produciendo un ARN rápido que puede ser un subproducto de la regulación de la antiterminación.
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Demostramos que este transcrito temporal se une a la chaperona de ARN pequeño Hfq, y se procesa adecuadamente en un ARN pequeño regulador suave de 74 nt que ahora hemos denominado StxS. StxS reprime la expresión de la toxina Shiga 1 bajo condiciones lisogénicas mediante interacciones directas con el transcrito stx1AB. StxS actúa en trans para activar la expresión del último desafío sigma de respuesta al estrés, RpoS, mediante interacciones directas con una secuencia semilla activadora a lo largo de la 5′ UTR. La activación de RpoS promueve la mejora extrema de la densidad celular en condiciones de limitación de nutrientes. Muchos fagos se benefician de la antiterminación para manejar el cambio lítico/lisogénico y nuestros resultados muestran que los ARN temporales generados como subproducto de esta regulación deberían adquirir opciones de ARN pequeños reguladores que modulan el bienestar del huésped.
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Metagenomic Insights into the Sewage RNA Virosphere of a Giant Metropolis (Perspectivas metagenómicas de la virosfera de ARN de las aguas residuales de una gran metrópolis)
Los virus asociados a las aguas residuales podrían desencadenar numerosas enfermedades humanas y animales, como gastroenteritis, hepatitis e infecciones respiratorias. Debido a esta realidad, su detección en las aguas residuales puede reflejar las infecciones actuales a través de los habitantes de la disposición.
Hasta la fecha, no se ha realizado ningún análisis viral de las aguas residuales de ninguna gran metrópolis sudamericana.
En este análisis, se utilizó metagenómica viral para amasar una sola muestra instantánea de la virósfera de ARN a través de las aguas residuales de Santiago de Chile, la séptima metrópoli más grande de las Américas.
A pesar de la sobrerrepresentación de virus dsRNA, nuestros resultados muestran que la virosfera de ARN de las aguas residuales de Santiago estaba compuesta en gran parte por secuencias desconocidas (88%), mientras que las secuencias virales reconocidas estaban dominadas por virus que infectan microorganismos (60%), invertebrados (37%) y humanos (2,4%).
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Aparentemente, descubrimos tres nuevos genogrupos en toda la familia Picobirnavirida, que llenarán lagunas esenciales en el historial evolutivo de este taxón. Además, hemos demostrado el predominio de nuevos genotipos de rotavirus, como G8 y G6, que han desplazado a genotipos clásicos totalmente diferentes, lo que coincide con las investigaciones científicas más recientes.
Este análisis contribuye a la utilidad de la metagenómica viral de aguas residuales para la vigilancia del bienestar público. Además, demuestra la necesidad de vigilar la mitad viral por el remedio de aguas residuales y reciclaje curso de, el lugar este virome puede caracterizar un reservorio de patógenos humanos.
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Una nueva plataforma para acelerar las pruebas de susceptibilidad a los antimicrobianos en Neisseria gonorrhoeae mediante firmas de ARN
El aumento de patógenos resistentes a los antimicrobianos puede muy bien atribuirse a la escasez de una identificación rápida del patógeno (ID) o de pruebas de susceptibilidad a los antimicrobianos (AST), lo que da lugar a retrasos en la selección terapéutica en el punto de atención. La gonorrea suele tratarse de forma empírica sin obtener resultados de las pruebas de sensibilidad antimicrobiana antes del tratamiento, lo que contribuye al rápido aumento de la farmacorresistencia.
En este artículo presentamos una plataforma AST rápida que utiliza firmas de ARN para Neisseria gonorrhoeae (NG). RNA-seq adoptada por los dispositivos bioinformáticos se habían utilizado para encontrar marcadores potenciales en todo el perfil transcriptoma de NG a los minutos de publicidad azitromicina. La validación de los marcadores candidatos mediante qRT-PCR confirmó que dos marcadores (arsR (NGO1562) y rpsO) pueden enviar resultados correctos de AST a través de 14 aislados examinados.
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La validación adicional de nuestro umbral de susceptibilidad en comparación con la CMI en otros 64 aislados confirmó la fiabilidad de nuestra plataforma. Nuestros marcadores de ARN mezclados con las aplicaciones moleculares de punto de atención en aumento tienen el potencial de acelerar considerablemente cada ID y AST para informar el remedio.
Fuentes :
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